Pre europoslankyňu je to druhé dieťa, z prvého manželstva má dnes už dospelého syna Martina. Jej manželstvo s reklamným mágom Fedorom Flašíkom bolo bezdetné. Otcom Beňovej bábätka je advokát Ľubomír Klčo (36), s ktorým spolupracuje už dlhé roky. Politička však doteraz nikdy nepotvrdila, že by s o 15 rokov mladším mužom tvorila pár.
Klčo má advokátsku kanceláriu v hlavnom meste. Je synom sudkyne Janky Klčovej, ktorá pracuje na Krajskom súde v Trnave a šéfa trnavskej prokuratúry. Viedol Beňovej kampaň, keď v roku 2014 kandidovala na post predsedníčky Bratislavského samosprávneho kraja aj jej kanceláriu v Bruseli.
Advokát bol pred rokom bol spomínaný v prípade kontroverzného výkupu pozemkov pod bratislavským nultým obchvatom, kde sa mal spolu s ďalšími tromi mužmi obohatiť o niekoľko miliónov.
