Keď v roku 2002 polícia objavila v taške na dne rokliny na ostrove Cebu telesné pozostatky jeho manželky, Ecleo bol práve vtedy vodcom skupiny s názvom Filipínske združenie dobročinných misionárov (PBMA).
LOOK | UPDATE: Former congressman Ruben Ecleo, Jr. presented to the media following his arrest in San Fernando, Pampanga on Thursday, eight years after he was convicted in 2012 for his wife’s death in 2002. Details here: https://t.co/pE7wTQDuxP
— The Freeman (@TheFreemanNews) July 30, 2020
| Photos from @PhilippineStar pic.twitter.com/27iGLi0sa5
Zatkli ho o niekoľko mesiacov neskôr pri policajnom zásahu v jeho dome na ostrove Dinagat, pri ktorom zahynulo 17 ľudí. V roku 2004 prepustili Eclea na kauciu a v roku 2010 sa stal poslancom filipínskej Snemovne reprezentantov. Podľa komentára agentúry AFP ide o príklad beztrestnosti v tejto ázijskej krajine, kde sa bohatí a mocní ľudia často vyhýbajú spravodlivosti.
V roku 2012, rok po tom, čo prestal chodiť na súdne pojednávania, ho v Cebu odsúdili za zabitie manželky na 30 rokov väzenia.
Polícia v Manile označila Eclea za "najhľadanejšieho zločinca" na Filipínach. Podľa policajnej správy bol vo štvrtok zatknutý v uzavretej rezidenčnej oblasti v severnej časti mesta Angeles, kde žil pod iným menom. Polícia okrem neho zadržala aj jeho vodiča, ktorý sa Ecleovmu zatknutiu snažil zabrániť.
V roku 2006 ho iný súd odsúdil za korupciu spáchanú na začiatku 90. rokov 20. storočia, keď zastával funkciu mestského starostu v Dinagate.
Ecleo sa stal vodcom Filipínskeho združenia dobročinných misionárov, ku ktorému sa hlási milión prívržencov, po smrti svojho otca Rubena Eclea st. v roku 1987. Ten založil túto skupinu ešte v roku 1965.