Tam sa za 25 sezón prepracoval v historickej produktivite súťaže až na druhé miesto za nedosiahnuteľného Wayna Gretzkého, v poradí strelcov je tretí. Svoj debut v najslávnejšej hokejovej lige sveta si odbil 5. októbra 1990 v drese tímu Pittsburgh Penquins, ktorý vtedy porazil Washington Capitals 7:4
Jágr si v zápase pripísal jednu strelu a dve plusové body a už o dva dni neskôr prvýkrát skóroval v NHL, keď sa presadil proti New Jersey Devils. Vo farbách Penguins po boku hviezdneho Maria Lemieuxa zdvihol Jágr dvakrát nad hlavu Stanley Cup. Po troch rokoch strávených v ruskom Omsku, s ktorým v roku 2005 počas výluky v NHL vyhral turnaj európskych majstrov Super Six, sa do zámoria vrátil. Prešiel Philadelphiou, Dallasom, Bostonom, New Jersey, Floridou a jeho poslednou zastávkou bol v roku 2017 tím Calgary Flames.
Jágr celkovo v základnej časti NHL odohral 1733 zápasov v ktorých nazbieral 1921 bodov za 766 gólov a 1155 asistencií. V play off pridal ďalších 201 bodov. V roku 2018 kvôli zdravotným problémom predčasne ukončil pôsobenie v Calgary a vrátil sa do Kladna, ktoré minulú sezónu odohralo v najvyššej českej lige, ale účasť medzi elitou neobhájilo a teraz sa klub, ktorého je Jágr majiteľom, chce opäť vrátiť z prvej ligy.
Vďaka olympijskému zlatu z Nagana, dvom titulom majstra sveta a dvom triumfom v Stanley cupe je Jágr členom prestížneho Triple Gold Clubu.
