Vyhláška hlavného hygienika SR z 27. decembra 2020 umožnila koncom roka poslancom Národnej rady SR rokovať aj napriek tomu, že boli viacerí pozitívne testovaní na ochorenie COVID-19 alebo boli po kontakte s pozitívnou osobou v preventívnej karanténe. Porušenie vidí aj vo vyhláške z 10. januára 2021, ktorá sa týka nariadenia karanténnych povinností osôb pri vstupe na územie SR. Úrad podľa Žilinku nemal oprávnenie upraviť výnimky z izolácie a karantény a výnimky pre osoby v osobitnom režime.
"ÚVZ v ustanovení výnimiek prekročil rozsah svojej pôsobnosti a povolil ich nad rámec zákona," skonštatoval Žilinka. Voči obom výnimkám podala Generála prokuratúra (GP) SR protest. Žilinka doplnil, že ÚVZ bude mať 30 dní, aby zareagoval, a následne 90 dní, aby protestu vyhovel. Šéf prokurátorov avizoval, že sa môže obrátiť aj na Ústavný súd. Protesty boli doručené ÚVZ vo štvrtok.
Na základe decembrovej vyhlášky poslanci rokovali o núdzovom stave za neštandardných podmienok. Pozitívni poslanci a zákonodarcovia po kontakte s pozitívnym človekom boli od negatívnych oddelení fóliou. Mali podľa Kancelárie NR SR samostatný vchod. V priestoroch mali byť germicídne žiariče. Poslanci mali aj respirátory.
Minister zdravotníctva Marek Krajčí (OĽaNO) na tlačovej konferencii uviedol, že ide o rozhodnutia hlavného hygienika, o ktorých spolu nediskutovali. „Osobne si myslím, že sa tým vážne musíme zaoberať,“ povedal. Zároveň polemizoval, či je nezákonné, ak mal zdravotný pracovník pozitívny test, no cíti sa dobre, aby nepracoval napríklad v červenej zóne za dodržania všetkých bezpečnostných opatrení. Krajčí podotkol, že ich postup v danej veci oznámia až vtedy, keď sa s oboznámia s daným stanoviskom.
„Úrad verejného zdravotníctva SR nebol Generálnou prokuratúrou SR pri analýze predmetných vyhlášok požiadaný o vysvetlenie príslušných ustanovení ani nebol požiadaný o predbežnú reakciu na jej zistenia,“ reagoval ÚVZ na zistenia prokuratúry a dodal, že sa dôsledne oboznámia s obsahom stanoviska generálnej prokuratúry a potom sa k protestom prokurátora vyjadria.
Vyhláška povolila napríklad prezidentke, ministrom, poslancom parlamentu či generálnemu prokurátorovi pracovať aj v prípade pozitívneho testu na ochorenie COVID-19 či kontaktu s pozitívne testovaným. Prácu môžu vykonávať, ak by absenciou na pracovisku vážne ohrozili zabezpečenie chodu štátu alebo riešenie mimoriadnych úloh. Podmienkou je dodržiavanie prísnych protiepidemických opatrení. Medzi osoby v osobitnom režime sa nezaraďujú iba predstavitelia výkonnej či zákonodarnej moci. Patria sem aj zdravotníci, pracovníci v oblasti energetiky, tepelnej energetiky a podporných služieb v elektroenergetike.