Ten je vyšetrovaný pre marenie spravodlivosti a zneužitie právomoci verejného činiteľa v súvislosti so zásahom policajnej inšpekcie, ktorá chcela zatknúť troch svedkov obvinených z krivej výpovede.
Problémom je telefonát Kovaříka v deň akcie, ktorá mala zadržať troch svedkov obvinených z krivých výpovedí. Podľa prokurátora Juraja Chylu, ktorý vzniesol obvinenie, nemal právo zasahovať do práce policajnej inšpekcie, ktorá si na akciu povolala kukláčov z cudzineckej jednotky zo Sobraniec.
Ak mal pochybnosti o tom, či bolo povolanie komanda oprávnené, tak mal počkať na dokončenie zásahu a následne to celé preveriť, aby neohrozil bezpečnosť zasahujúcich príslušníkov. „Svojím pokynom bez právne relevantného dôvodu okamžite ukončil činnosť určených policajtov Mobilnej zásahovej jednotky Sobrance pri zadržiavaní obvinených Petrova a Zemana a iných procesných úkonov,“ píše sa v uznesení, ktoré citoval Denník N.