Na ministerstvo vnútra už doručil žiadosť o uvoľnenie zo služobného pomeru. Odísť chce k 15. septembru, po návšteve pápeža Františka na Slovensku. Odchádza do civilu. Oznámil to v utorok počas tlačovej konferencie.
Kovařík tvrdí, že si nevie predstaviť zotrvať vo funkcii policajného šéfa ako obvinený. „Neviem si predstaviť, ako by som dával rozkazy svojim kolegom, keby som ostal vo funkcii," zdôraznil policajný prezident. Vedením polície by podľa Kovaříka po jeho odchode mala byť dočasne poverená súčasná prvá viceprezidentka Jana Maškarová.
Peter Kovařík v tejto súvislosti konštatoval, že svoj odchod navrhol ministrovi vnútra Romanovi Mikulcovi (OĽaNO) on sám. „Od pána ministra som mal plnú podporu," uviedol. Dodal, že po odchode z polície si chce oddýchnuť a následne „žiť svoj život".
Peter Kovařík doplnil, že si naďalej myslí, že pri prerušení zákroku policajnej inšpekcie konal správne. „Ja som preveroval zákonnosť toho zásahu," povedal s tým, že na základe jeho vyhodnotenia si zásahovú jednotku vyžiadala neoprávnená osoba. „Myslím si, že som bol oprávnený rozhodnúť," vyhlásil s tým, že keď vec skonzultoval so šéfom inšpekcie, dal povolenie k pokračovaniu zákroku. Zároveň Peter Kovařík ozrejmil, že pred predmetným zásahom sa šírili informácie, že majú byť zatknutí viacerí vyšetrovatelia a prokurátori. Takéto niečo by podľa neho bolo „za hranou", preto si informácie overoval u krajských policajných riaditeľov. Tí mu títo informácie nepotvrdili. „Na niekoľkých zasadnutiach Bezpečnostnej rady som bol vyzvaný, aby som dbal na to, aby zásahovky neboli využívané neadekvátne," vysvetlil.
Policajný prezident tiež zdôraznil, že naďalej dôveruje policajtom z tímov Očistec a Fénix, ktorí vyšetrujú medializované kauzy. „Ja verím, že kauzy, ktoré sú otvorené, tak sú postavené na reálnych základoch a dotiahne sa to do konca," doplnil.
Minister vnútra SR Roman Mikulec (OĽaNO) je presvedčený o tom, že obvinený policajný prezident Peter Kovařík sa nedopustil žiadneho protiprávneho konania. Vo svojom statuse na sociálnej sieti zároveň ocenil rozhodnutie Petra Kovaříka odstúpiť z funkcie policajného prezidenta. Tento krok si váži o to viac, že má zásadné pochybnosti o obvinení, ktoré bolo vznesené. Zároveň je presvedčený, že toto obvinenie bolo účelové. Minister vnútra tiež zdôraznil, že Peter Kovařík má jeho dôveru.
„Skutočnosť, že sa rozhodol z funkcie odísť preto, aby chránil česť a dôveryhodnosť Policajného zboru, svedčí o jeho vysokom morálnom kredite, snahe chrániť Policajný zbor a ísť príkladom pre jeho príslušníkov,“ napísal Mikulec. Toto rozhodnutie vníma ako skutočné štátnické gesto a váži si Petra Kovaříka aj ako prezidenta Policajného zboru, aj ako človeka.
Krajská prokuratúra Bratislava vzniesla 26. augusta obvinenie voči prezidentovi Policajného zboru Petrovi Kovaříkovi pre zločin zneužívania právomoci verejného činiteľa v súbehu so zločinom marenia spravodlivosti. Policajný prezident mal podľa prokuratúry zmariť prebiehajúci zásah zadržania, ako aj vykonanie nasledovných trestno-procesných úkonov s obvinenými Matejom Zemanom a Petrom Petrovom.
Kovařík bol od septembra 2020 poverený dočasným riadením Policajného zboru. Koncom januára 2021 ho po výberovom konaní do funkcie prezidenta Policajného zboru vymenoval minister vnútra Roman Mikulec (OĽANO).