Rokovací poriadok NR SR hovorí, že návrhy kandidátov na predsedu a podpredsedov NKÚ môžu podávať poslanci. Súčasťou návrhu musí byť prehľad o vzdelaní a praxi navrhovaných a ich písomný súhlas s kandidatúrou. Za šéfa úradu je zvolený kandidát, ktorý získa vo voľbe nadpolovičnú väčšinu hlasov prítomných poslancov.
Voľba predsedu sa podľa rokovacieho poriadku koná najneskôr 30 dní pred uplynutím funkčného obdobia. Súčasného predsedu NKÚ Karola Mitríka zvolili poslanci v roku 2015 na sedem rokov. Z Ústavy SR vyplýva, že tá istá osoba môže byť zvolená za predsedu NKÚ najviac v dvoch po sebe nasledujúcich sedemročných obdobiach.
NKÚ kontroluje hospodárenie s prostriedkami rozpočtov, ktoré schvaľuje NR SR alebo vláda SR. Kontroluje tiež hospodárenie s majetkom štátu, verejnoprávnych inštitúcií alebo samospráv. Kontroluje napríklad spôsob vyrubovania a vymáhania daní, ciel odvodov alebo poplatkov. Vypracúva napríklad i stanovisko k návrhu štátneho rozpočtu.
sum tur