Navrhuje sa, aby generálny prokurátor nemohol zrušiť obvinenie v konaniach, v ktorých už konal súd. "T. j. ak rozhodol o vzatí obvineného do väzby alebo nahradení väzby, alebo ak bol na obvineného vydaný európsky zatýkací rozkaz alebo medzinárodný zatýkací rozkaz, alebo súd vydal v prípravnom konaní iné rozhodnutie, z ktorého vyplýva dôvodnosť a zákonnosť vznesenia obvinenia," uvádza sa v dôvodovej správe k legislatívnemu návrhu.
Cieľom je podľa ministerstva zamedziť konfliktu súdnych rozhodnutí s rozhodnutiami generálneho prokuratúra, a tým vyvolanému nežiaducemu efektu spochybňovania legitimity rozhodnutí súdov.
V súčasnosti má generálny prokurátor právomoc zrušiť právoplatné rozhodnutie prokurátora alebo policajta, ak takým rozhodnutím alebo v konaní, ktoré mu predchádzalo, bol porušený zákon. Ministerstvo navrhuje precizovať znenie tohto ustanovenia na právomoc zrušiť právoplatné uznesenie prokurátora alebo policajta, "ak takým rozhodnutím bol porušený zákon v podstatných okolnostiach alebo pre podstatné chyby konania, ktoré mu predchádzalo".
