Pár týždňov po prvej zachytenej nákaze covidom sa stal členom permanentného ústredného krízového štábu a po tvrdom boji so zákerným ochorením bol prvým Slovákom, ktorý sa dal pred kamerami verejne zaočkovať novou vakcínou proti ochoreniu COVID-19. Jeho misia však nebola jednoduchá a musel čeliť aj útokom a vyhrážkam.
Zavreté školy, obchody, home office a prázdne ulice. Na jar v roku 2020 bolo nielen vo svete, ale aj v uliciach Slovenska cítiť strach. Strach pred vírusom, o ktorom nikto nič nevedel a dalo sa len špekulovať. Jedno však bolo isté. Zabíja a zabíja bez výnimky. A vedel to aj samotný profesor Krčméry.
Vo svojom živote a svetových misiách prekonal maláriu, MERS a ďalšie infekčné ochorenia, covid bol však niečo, čo prekvapilo aj jeho. Po zavedení prvého lockdownu navštívil Nový Čas, kde obhajoval opatrenia vlády a vysvetľoval dôležitosť používania rúšok: „Je lepšie dať si rúško, ako si ho nedať. 90 % efektu je už to, že ho máte. Tých 10 % je, že aké rúško máte. Takže, samozrejme, že je ideálne, keď máte kvalitné, ale ak ich nemáme, vôbec nič sa nedeje. Rúško nás chráni pred kvapôčkou a pred epitéliou, to sú veľké bunky a vírus je v nich,“ apeloval na ľudí.