S vážnymi zdravotnými problémami bojoval s prestávkami už od roku 2018. Aj posledné týždne trávil na nemocničnom lôžku, jeho stav sa rapídne zhoršoval. Stihol ešte vidieť finále majstrovstiev sveta a zablahoželať k prvenstvu Messimu a Argentíne.
Smrť Pelého oznámila na sociálnej sieti jeho dcéra Kely Nascimento: „Všetko, čím sme, je len vďaka tebe. Ľúbime ťa navždy. Odpočíval v pokoji,“ napísala k fotografii rúk členov rodiny držiacich Pelého dlaň s viditeľným detailom infúzie. Nechýbala posledná z jeho troch manželiek Marcia Aoki.
Rozvetvená família vrátane 7 priznaných detí dostala od lekárov z nemocnice Alberta Einsteina v Sao Paule správu, aby sa so svojím milovaným prišli radšej rozlúčiť. Jeho zdravie sa rýchlo zhoršovalo, chemoterapia nezaberala. Na večnosť ho poslala rakovina hrubého čreva, ktorú mu diagnostikovali pred 4 rokmi v III. fáze ochorenia. Po operácii hrubého čreva (2021) trpel aj problémami s obličkami a prostatou. Ku komplikáciám sa pred Vianocami pridal aj covid, hoci Pelé bol od jari 2021 zaočkovaný.