Chlapec išiel pred svojím zmiznutím navštíviť kamaráta, posledný ho videl známy lekár. Polícia vyhlásila pátranie po chlapcovi tri dni po jeho zmiznutí. Pri pátraní boli nasadené vrtuľníky s termovíziou, potápači prehľadávali Vltavu, rodičom sa ozvali psychotronici aj ďalší údajní svedkovia.
Pátranie však nikam neviedlo, nevypočutá zostala aj ponuka rodičov, ktorí necelý mesiac po zmiznutí sľúbili za jeho nájdenie miliónovú odmenu. Podľa polície je najpravdepodobnejšia verzia, že chlapec sa utopil vo Vltave.
Honzíkova matka v roku 2018 požiadala o nahliadnutie do pátracieho spisu, polícia jej to však nepovolila. O rok neskôr sa matky zastal Ústavný súd, ktorý ju svojím rozhodnutím nahliadnuť do spisu umožnil.
Pátranie po stratených osobách sa končí po 20 rokoch od ich zmiznutia, potom nasleduje archivácia spisového materiálu.