Opäť na vrchole
Isté uvoľnenie v Jakubiskovom prípade nastalo až v 80. rokoch, keď opäť mohol natáčať aj filmy, hoci iba historické, rozprávky a komédie. Využil to dokonale a aj vďaka tomu sa do zlatého fondu našej kinematografie dostali skvosty ako Nevera po slovensky (1980), Tisícročná včela (1983), Perinbaba (1985) či Pehavý Max a strašidlá (1987) zostrihaný zo seriálu Teta. Pár mesiacov pred Nežnou revolúciu mala tiež premiéru jeho poetická komédia Sedím na konári a je mi dobre (1989).
Milenka, manželky a deti
Fenomenálny režisér prirodzene priťahoval herečky. Jeho najkrajšou milenkou bola svojho času jedna z najsexi žien sveta, česká herečka Olga Schoberová. „V oválnom zrkadle zavesenom na dverách skrine, ktoré sem priniesla Olina, vidím odraz dvoch nahých postáv. Žena, ktorá ma v spánku objíma, má neskutočne dokonalé telo. Je dokonalejšia a krajšia než všetky dievčatá, ktoré som poznal... Keby som mal umrieť teraz, umrel by som šťastný...“ zaspomínal si vo svojej knihe na krátke obdobie, keď fungovali ako pár. Do manželstva sa dlho nehrnul.
Pred oltár sa nakoniec postavil až v roku 1975 a jeho vyvolenou sa stala Ľudmila Vašová. Manželstvo im vydržalo deväť rokov a narodila sa v ňom dcéra Janetta. Osudovou ženou pre Jakubiska sa však nakoniec stala temperamentná herečka Deana Horváthová, ktorú si zobral v roku 1985. Splodili syna Jorika, pričom manželia sa po čase stali aj blízkymi spolupracovníkmi v produkčnej firme.