V jednej z kruhových miestností s priemerom približne tri metre mohli pozorovať obete nakazenia patogénmi alebo chemickým látkami. Celé podzemné zariadenie pozostáva z niekoľkých tunelov a komôr.
Aby sa zabránilo šíreniu nákazy, niektoré z nehumánnych experimentov sa diali v podzemí. Výsledky najnovšieho výskumu boli nedávno publikované v časopise Northern Cultural Relics.
Výskumníci z Jednotky 731 porušovali lekársku etiku podobným spôsobom ako Josef Mengele v koncentračnom tábore Auschwitz. Napríklad nakazili zajatcov týfom alebo cholerou a potom ich ešte zaživa pitvali, aby videli vplyv choroby na telo predtým, ako nastane posmrtný rozklad. Na živých väzňoch tiež skúmali účinky zbraní či infekčnosť chorôb a neskôr tieto zistenia použili proti nepriateľom.