Kľúčové postavy tajného vojenského programu po vojne dostali od okupačnej správy imunitu voči trestnému stíhaniu výmenou za poskytnutie výsledkov výskumu.
Veliteľ Jednotky 731 Širó Išii tak mohol pokračovať vo svojom lekárskom výskume v Japonsku až do prirodzenej smrti v roku 1959. Jeho zdôvodnenie, prečo aj po zákaze testovania bakteriologických zbraní Ženevským protokolom z roku 1925 v testoch pokračoval, znelo: nebolo by to zakázané, keby to nebolo účinné. Tokio priznalo existenciu Jednotky 731 až po desaťročiach zapierania.