Do jeho života však čoraz viac zasahoval pokrok a nakoniec dospel k záveru, že len násilnými útokmi môže upozorniť na narastajúcu eróziu ľudskej slobody a dôstojnosti v modernom svete.
Kaczynski začal rozosielať bomby v roku 1978 ľuďom, ktorí boli spojení s novými technológiami (predtým pracoval krátko s otcom a bratom v továrni na gumu). Prvé boli veľmi primitívne, no postupne sa stávali čoraz sofistikovanejšie. Keďže ich dostávali prevažne univerzity a aerolínie, zatiaľ neznámy útočník dostal prezývku Unabomber (University and Airline bomber).
V roku 1995 Kaczynski poslal médiám niekoľko listov, v ktorých písal, že prestane s útokmi, ak médiá zverejnia jeho esej Priemyselná spoločnosť a jej budúcnosť, prezývanú Unabomberov manifest, čo sa aj stalo. Text si prečítal aj David Kaczynski, ktorý spoznal niektoré spojenia, typické pre svojho brata. Skontaktoval sa s federálnou políciou FBI, načo bol Kaczynski v roku 1996 zatknutý vo svojej chatrči.