Sám Bezák nevedel vysvetliť, čo na ňom Vatikánu prekáža, no skloňoval sa jeho záujem o preverovanie finančných nezrovnalostí. Najnovšie vyšlo na povrch, že Bezák sa snažil s Ústavom pamäti národa (ÚPN) dohodnúť na skúmaní toho, ktorí kňazi z arcidiecézy donášali ŠtB počas socializmu.
Bezák skončil na začiatku júla 2012 a ešte aj pred pár mesiacmi robil kroky k tomu, aby svoje meno pred Vatikánom očistil. Pápež František ho podľa jeho slov minimálne symbolicky rehabilitoval, keď ho prijal vo Vatikáne, alebo mu povolil byť po jeho boku na omši v Šaštíne či na súkromnej audiencii pri návšteve hlavy katolíckej cirkvi na Slovensku. Denník N najnovšie zistil, že Bezák s Ústavom pamäti národa (ÚPN) uzatvoril pred svojím odchodom zmluvu, na základe ktorej sa malo skúmať, ktorí kňazi kolaborovali s bývalým režimom a stali sa z nich udavači. Projekt mal vyvrcholiť vedeckou publikáciou, kto z cirkevných predstaviteľov Trnavskej arcidiecézy v rokoch 1945 až 1989 spolupracoval so Štátnou bezpečnosťou (ŠtB) a za akých okolností to podpísal.
Citlivá vec
Išlo o citlivú záležitosť, keďže medzi agentmi bol evidovaný aj Bezákov predchodca Ján Sokol. Bezák hovorí, že prvotné zistenia z archívov ÚPN odhalili tretinu kňazov z Trnavskej diecézy. Tímy ÚPN a diecézy skúmali, prečo začali donášať, či to bolo dobrovoľné rozhodnutie, alebo boli donútení k spolupráci.
