Súdni znalci u Hepnarovej diagnostikovali poruchu osobnosti, konštatovali však, že netrpí duševnou chorobou a je za čin plne zodpovedná. V apríli 1974 ju Mestský súd v Prahe uznal za vinnú a odsúdil na smrť. Verdikt neskôr potvrdili tiež odvolacie súdy, aj žiadosť jej matky o milosť prezident zamietol. V tom čase 23-ročná vrahyňa bola popravená 12. marca 1975. Tesne pred exekúciou v pankráckej väznici sa psychicky zrútila. Kládla odpor a k šibenici ju zriaďovatelia museli doslova dovliecť.