Safronova zatkla v júli 2020 ruská tajná služba FSB a obvinila ho, že zhromažďoval dôverné informácie o ruskej armáde, obrane a bezpečnosti a odovzdal ich spravodajskej službe členskej krajiny NATO. Podľa RFE/RL išlo o českú rozviedku.
Išlo údajne o tajné informácie o vojensko-technickej spolupráci Ruska v Afrike a o činnosti ruských ozbrojených síl na Blízkom východe. Konečným príjemcom týchto informácií boli podľa FSB Spojené štáty.
Safronov tieto obvinenia odmietal a pred vyšetrovateľmi sa bránil, že jeho články boli založené na analýze informácií z otvorených zdrojov a na rozhovoroch s oficiálnymi predstaviteľmi.
Svoje obvinenie pripísal snahe FSB o "výrobu" špiónov, keď tých skutočných nedokáže odhaliť a dolapiť. Stredajšie pojednávanie v prípade jeho odvolania sa konalo za zatvorenými dverami. Novinári boli pozvaní len na vypočutie rozhodnutia súdu, ktorý ponechal trest nezmenený, informovali ruské tlačové agentúry.