Flašík bol onkologickým pacientom od roku 2010. Po rokoch začala choroba jeho telo sužovať čoraz viac a následne bol hospitalizovaný v ružinovskej nemocnici. Jeho najbližší priznali, že liečba na Slovensku viac nezaberala, a tak bol v umelom spánku transportovaný do susedného Česka.
Následne ho hospitalizovali v prestížnej nemocnici v pražskom Motole, kde špičkoví doktori pomáhali celej plejáde osobností. Podnikateľa však už zachrániť nedokázali, svoj dlhoročný boj s rakovinou nakoniec prehral.
Na zosnulého politického marketéra spomína aj jeho dlhoročný kamarát Boris Kollár, ktorý mu poslal srdcervúci odkaz do neba. "Fedko, tento status sa mi píše veľmi ťažko. Mám hrču v krku a slzy mi tečú po tvári. Čo sa k tomu dá napísať. Veľmi som sa o teba bál, pomôcť som ti nemal ako, tak som sa za teba modlil," uviedol zronený expolitik, pre ktorého bol Flašík viac ako priateľ.