Jej nástup do funkcie pred 5 rokmi nebol istý. Krátko pred najdôležitejším krokom v jej politickej kariére sa dozvedela správu, ktorá ju ako mamu dostala na kolená. O súkromí Čaputová prehovorila v knihe rozhovorov Nestratiť sa sama sebe, ktoré s ňou viedol Erik Tabery.
V knihe prezrádza, ako týždeň pred inauguráciou v roku 2019 zobrala dcéry Leu a Emmu k lekárovi. Lea zle doskočila na telesnej výchove a Emmu zobrala len preto, že mávala často migrény. Z na pohľad nerizikovej bolesti hlavy sa však vykľula diagnóza, ktorá exprezidentku vystrašila a sprevádzala ju počas nasledujúcich rokov. "Staršia dcéra bola v poriadku. Mladšej dcére však našli nádor na mozgu,“ prezradila exprezidentka s tým, že nasledujúce mesiace žili v neistote. "Pýtala sa ma: ‚Mami, čo sa deje?‘ A ja som sa snažila… Nepovedala som jej rovno, že ide o nádor, ale tak optimisticky som jej povedala, že ešte budú nejaké vyšetrenia," opisuje Čaputová, ktorá podľa vlastných slov zvažovala, či sa pre ochorenie jej vtedy len 15-ročnej dcéry vôbec chopí funkcie prezidenta.