V ostatných rokoch sa obsadzovaný herec objavil v populárnych seriáloch Záchranári (2003), Priateľky (2008), Odsúdené (2009), Ako som prežil (2009) a Pod povrchom (2012) alebo tiež v divácky obľúbenom seriáli z vinárskeho prostredia Búrlivé víno (2012). K novším patrili seriály Horná Dolná (2015 - 2020) či Strážmistr Topinka (2019).
K najnovším inscenáciám, v ktorých Štefan Kožka účinkoval, patrila hra Bosé nohy v parku, a tiež obnovená premiéra pôvodného slovenského rockového muzikálu Cyrano z predmestia.
Obľúbený herec Štefan Kožka zomrel 14. decembra 2020 vo veku 66 rokov v maďarskej prihraničnej obci Rajka, kde býval. Umelcovo telo našiel sused. Pred smrťou ochorel na covid a iba niekoľko dní pred skonom nahral video, v ktorom opísal ťažký priebeh ochorenia.