Nadácia Zastavme korupciu zopakovala, že pri reorganizácii polície mohol byť porušený zákon, pretože personálne rozkazy vopred neprerokovali policajné odbory. Na Národnej protidrogovej jednotke podľa nadácie chýbajú miesta finančných vyšetrovateľov a analytikov, ktoré boli vytvorené z plánu obnovy. Ako Zastavme korupciu tvrdí, môže to ohroziť čerpanie eurofondov, keďže Slovensko nedodržiava záväzky voči Európskej únii.
NAKA v rámci reorganizácie zanikla k 1. septembru. Nahradili ju tri novovzniknuté útvary. Súčasťou zmien bolo aj prevelenie asi 100 policajtov na iné oddelenia polície.