Kričal na neho, aby otvoril dvere. Zdá sa, že sa Lubitz snažil kapitána z kokpitu vylákať viackrát počas letu. Posielal ho na záchod a späť ho už nepustil. Kapitán letu 4U9525 sa zúfalo snažil dostať do kokpitu a znovu získať kontrolu nad lietadlom. To sa mu bohužiaľ nepodarilo.
Podľa prepisu z čiernych skriniek vyplýva, že kapitán Patrick Sondheimer kričal na druhého pilota. „Otvor tie prekliate dvere!“ sa rozliehalo celým lietadlom. Lubitz ho nemohol nepočuť. Lietadlo schválne nasmeroval do Álp, a tak zabil seba a aj všetkých ľudí na palube.
Záznam z čiernej skrinky začína pomerne normálne. Kapitán sa prihovára cestujúcim, no potom prichádza zmena. Zachytený je rozhovor kopilota Lubitza s kapitánom. Lubitz kapitánovi hovorí, že môže ísť na záchod kedykoľvek, že on za neho prevezme vedenie. Taktiež kapitána upozorňuje, že nešiel na záchod v Barcelone.
I rozhovor s riadiacou vežou pred pristátím bol podozrivý. Lubitz používal slová ako „snáď“ a „možno“. Keď prebehli kontroly, ktoré je treba vykonať pred pristátím, Lubitz opäť kapitánovi navrhol, aby šiel na záchod. Kapitán skutočné odchádza, je počuť pohyb sedadiel a o minútu neskôr, o 10:29, začína lietadlo klesať. Klesá tak rýchlo, že sa ho snaží kontaktovať aj riadiaca veža, ale márne.
Krátko po tom je počuť hlasné rany, niekto búcha na dvere a snaží sa dostať do kokpitu, je počuť aj kapitánov hlas. V pozadí sa rozlieha krik vydesených cestujúcich. V priebehu niekoľkých hrozných minút kapitán kričí hlasnejšie, opäť vyzýva Lubitza, aby otvoril dvere, ten ho však nepočúva. O 10:40 lietadlo naráža do horského úbočia.
Vyšetrovanie pádu lietadla, pri ktorom zahynulo všetkých 150 ľudí na palube sa v posledných dňoch sústredilo hlavne na osobu 27-ročného kopilota Lubitza. Nemecká prokuratúra v piatok uviedla, že mladý muž trpel nešpecifikovanými zdravotnými problémami, bol v trvalej starostlivosti lekárov, ale svoju chorobu pred zamestnávateľom skrýval. Nemecké médiá tvrdia, že sa liečil u psychiatrov a neurológov, posledné informácie spomínajú taktiež problém so zrakom.
Aj keď panuje podozrenie, že druhý pilot naviedol Airbus k zemi úmyselne, vyšetrovatelia stále nevylúčili ako príčinu pádu technickú chybu.