V polovici sedemnásteho storočia mali ľudia bližšie k prírode, bližšie k Bohu a bližšie k iracionálnym javom, ktoré dnes považujeme už len za rozprávky. Sedemčlenná rodina farmára Williama (Ralph Ineson), ktorá v tej dobe žila v relatívne bezpečnej osade v Novom Anglicku, sa po vážnom konflikte so susedmi rozhodla kolóniu opustiť a vydala sa dobývať americkú divočinu. Po krátkom putovaní sa usadili v zemi nikoho, blízko rozľahlého temného lesa. Zlé tušenie členov farmárovej rodiny podporujú aj nevysvetliteľné udalosti, ktoré sprevádzajú ich nový život.
Režisér David Eggers, ktorý vďaka Čarodejnici vyhral cenu za réžiu na festivale v Sundance, tvrdí, že čarodejnice boli hrdinkami väčšiny jeho nočných mor. „Zaujímal som sa o ne aj neskôr, keď som študoval čarodejnícke procesy. Čo tak strašného museli tie ženy spáchať, keď končili tak krutou smrťou?“ pýta se Eggers. Odpoveď možno nájdete v jeho filme.