Páchateľ posádku donútil, aby zmenila pôvodný kurz lietadla, ktoré malo letieť z Alexandrie do Káhiry, a pristála s ním na Cypre. Vyhrážal sa jej pritom aktivovaním výbušnín, ktoré boli - ako sa ukázalo neskôr - falošné. Cyperský prokurátor Andreas Lambrianou v stredu informoval, že podozrivý muž čelí viacerým obvineniam vrátane únosu lietadla, nezákonného držania výbušnín, únosu ľudí a vyhrážania sa násilím.
Dramatický únos lietadla sa skončil pokojne, keď cyperská polícia zatkla 59-ročného Egypťana, identifikovaného ako Sajf Addín Mustafa. Ujmu na zdraví neutrpel žiaden zo 72 ľudí na palube lietadla Airbus A320. Cyperskí predstavitelia už v utorok vyhlásili, že páchateľovo konanie zrejme nesúvisí s terorizmom, ale týka sa vzťahu s bývalou manželkou, ktorá momentálne žije v Larnake. Podľa stredajšieho vyhlásenia prokurátora muž polícii povedal: "Čo má robiť človek, ktorý 24 rokov nevidel svoju ženu a deti a egyptská vláda mu to nedovolí?"