Televízia Fox News predtým s odkazom na zdroje z Federálneho úradu pre vyšetrovanie (FBI) oznámila, že prokurátori žiadajú veľkú porotu, aby Salmanovú obvinila zo spoluviny zo 49 vrážd, 53 pokusov o vraždu, neinformovanie polície o chystanom útoku a klamstva federálnym agentom. Televízia NBC News uviedla, že Salmanová agentom povedala, že sa snažila manželovi útok vyhovoriť. Tiež ale FBI povedala, že raz ho do orlandského klubu Pulse zaviezla, pretože si to tam chcel obhliadnuť.
Policajti vyšetrujúci nedeľný masaker doteraz nezverejnili motív činu. Mateen podľa vyšetrovateľov počas svojej akcie v klube volal na krízovú linku, aby sa vyznal z príslušnosti k rôznym islamistickým skupinám vrátane Islamského štátu. Omarov otec Seddique ale vylučuje, že by za synovým útokom bol radikálny islam a jeden z Omarových známych povedal, že mohol mať problém so svojou vlastnou sexuálnou orientáciou; útočníka totiž poznal ako častého návštevníka podniku.
Podľa FBI sa Mateen zrejme radikalizoval sám, pretože zatiaľ nie sú dôkazy, že by dostával inštrukcie alebo pomoc od zahraničných islamistov. Vyšetrovatelia mu ale stále ešte prehľadávajú mobilný telefón a ďalšie komunikačné zariadenia. Dvadsaťdeväťročný Mateen bol americký občan z rodiny afganských prisťahovalcov. Podľa jedného zo zdrojov z vyšetrovania si Mateen prezeral na internete radikálne islamské materiály najmenej dva roky pred nedeľňajším útokom.