V rozhovore s novinármi na palube pápežského leteckého špeciálu cestou z Arménska tiež varoval pred "balkanizáciou" Európy ako dôsledku odchodu Británie z Európskej únie.
František podľa agentúry Reuters tiež povedal, že cirkev by mala požiadať o odpustenie aj za to, ako konala so ženami, ako privierala oči nad detskou prácou a za to, že v minulosti "požehnala mnohým zbraniam".
Pápež tak v uvoľnenom rozhovore, ktorý sa stal typickým znakom jeho ciest do zahraničia, reagoval na otázku, či súhlasí s nedávnym výrokom nemeckého kardinála, že cirkev by sa mala homosexuálom ospravedlniť. Podľa Reuters vyzeral František smutne, keď sa ho jeden z novinárov opýtal, či je ospravedlnenie naliehavejšie po nedávnej streľbe v gay klube v americkom Orlande, pri ktorej zomrelo 49 ľudí.
Katolícka cirkev učí, že homosexuálne sklony nie sú hriechom, ale styk medzi osobami rovnakého pohlavia už áno, a že by homosexuáli mali žiť cudne. Pápež František je ale v tejto otázke považovaný za liberálnejšieho ako jeho predchodcovia. Za to ho kritizujú konzervatívnI katolíci.
V druhej časti rozhovoru potom František varoval, že po Brexite by sa mohlo osamostatniť napríklad Katalánsko alebo Škótsko, čo by nakoniec viedlo k "balkanizácii" Európy. Pápež dúfa, že únia po odchode Británie nájde novú formu fungovania. "V tej ohromnej únii niečo nefunguje, ale nevylievajte s vaničkou aj dieťa, skúsme veci znova naštartovať a znova vytvoriť," uviedol.
Poprel tiež špekulácie, že dianie vo Vatikáne naďalej výrazne ovplyvňuje bývalý pápež Benedikt, ktorý odstúpil v roku 2013. "Je tu len jeden pápež," povedal. Počul vraj, že niektorí cirkevní činitelia si išli na neho a jeho liberálnu politiku k Benediktovi sťažovať. Benedikt ich "poslal, nech sa zbalia," vyhlásil František.