K incidentu došlo počas bohoslužby v meste Medan, metropole provincie Severná Sumatra. Podľa polície páchateľ vstal z lavičky a rozbehol sa k oltáru za kňazom. Zároveň aktivoval nálož v batohu, ktorá však nevybuchla. Explodovala len rozbuška, ktorá ho zranila. S horiacom batohom však pokračoval v behu, vytiahol nôž a bodol kňaza do ľavej ruky. Útočníka vzápätí spacifikovali veriaci.
Motív útoku nebol bezprostredne známy. Polícia však v batohu útočníka objavila logo pripomínajúce znak teroristickej organizácie Islamský štát (IS). Muž sa údajne priznal, že nekonal sám a že útok mu nariadili. Indonézia, štát s najväčším počtom obyvateľov hlásiacich sa k islamu, zažila už množstvo útokov zo strany islamských radikálov.