V čele vojenskej junty, ktorá vládla tejto juhoamerickej krajine od začiatku 70. rokov, stál v rokoch 1981 až 1985. S odvolaním na vojenskú nemocnicu o tom informoval tamojší denník El País.
Álvarez bol predstaviteľom vojenskej diktatúry, ktorá v Uruguaji vládla od puču v roku 1973. Veliteľom armády sa stal v roku 1978 a vojaci pod jeho vedeným viedli brutálny boj proti ľavicovej gerile Tupamaros, ktorej členom bol okrem iných aj José Mujica, ktorý bol uruguajský prezidentom v rokoch 2010 až 2015.
Po sérii veľkých demonštrácií v roku 1984 umožnil Álvarez po 13 rokoch prvé slobodné voľby, po porážke v nich v nasledujúcom roku odstúpil z funkcie hlavy štátu, a Uruguaj sa tak vrátil k demokracii.
V roku 2007 Álvarez skončil vo väzbe kvôli zločinom spáchaným počas jeho vlády. O dva roky neskôr ho súd poslal za podiel na smrti či zmiznutie 37 Uruguajcov na 25 rokov za mreže.
