Nemcova zavraždili v roku 2015, keď kráčal po moste v blízkosti Kremľa. Nemcova podľa verdiktu poroty zastrelil Zaur Dadajev, bývalý príslušník bezpečnostných síl čečenského vodcu Ramzana Kadyrova. Štyroch ďalších uznala za vinných z účasti na tejto vražde, informovali ruské tlačové agentúry.
Trúfalá vražda vyvolala šok v celej ruskej opozícii. Nemcovovi spojenci kritizovali vyšetrovateľov za to, že neskúmali prípadnú úlohu vysokopostavených čečenských dôstojníkov a ani samotného Kadyrova v tejto vražde.