Hlava katolíckej cirkvi stále verí v Barrosovu nevinu, výrok na jeho obhajobu ale ľutuje kvôli zraňujúcemu dopadu. Františkovo nedeľné vyjadrenie v lietadle na ceste z Peru do Vatikánu v pondelok označila agentúra Reuters za výnimočný prípad pápežovej sebakritiky.
Pápež sa ospravedlnil obetiam kňazského zneužívania za svoje vyhlásenie, ktoré podľa neho "mnohých zranilo," čo si vraj v tej chvíli neuvedomil. Niekoho zraniť nemal vôbec v úmysle. Zároveň ale dodal, že si je istý, že Barros je nevinný. Ponechá ho tiež vo funkcii biskupa juhočilského Osorna. "V deň, keď mi prinesú proti Barrosovi dôkaz, prehovorím," povedal pápež vo štvrtok novinárom na záver návštevy Čile. "Nie je proti nemu ani zrnko dôkazu. Všetko sú klebety. Je to jasné?" dodal pred odletom do Peru. Tento komentár podľa agentúry AP šokoval obete zneužívania aj mnohých ďalších Čiľanov. Za "obrovskú chybu" ho označil politológ Germán Silva z univerzity v Santiagu de Chile.
Sexuálny škandál podkopal vážnosť cirkvi v Čile a pápežova návšteva mala situáciu zlepšiť. Barros bol dlhoročným blízkym spolupracovníkom kňaza Fernanda Karadimy, ktorého Vatikán v roku 2011 uznal vinným zo sexuálneho a psychického zneužívania mladistvých. Niektoré z Karadimových obetí požadujú Barrosovo odvolanie, pretože podľa nich o Karadimovom správaní vedel a nezasiahol. Barros obvinenia odmieta.