Útočník podpísal s "kanoniermi" zmluvu na tri roky a prestupová čiastka je približne 64 miliónov eur - nový transferový rekord Arsenalu.
Dvadsaťosemročný útočník opustil nemecký tím po 4,5 roku.
"Pierre-Emerick urobil pre nás skvelé veci. Dal veľa dôležitých gólov a bol dôležitou súčasťou mužstva pri minuloročnom zisku Nemeckého pohára. Želáme mu všetko najlepšie v jeho ďalšej kariére," citoval športového riaditeľa Dortmundu Michaela Zorca portál mirror.co.uk.
Kapitán gabonskej reprezentácie odohral za Borussiu 144 bundesligových zápasov, v ktorých dal 98 gólov.