Tridsaťdvaročná kráska, ktorá s manželom Brianom vychováva troch spoločných synov, sa so Shiaom stretla v rokoch 2007 a 2009 pri natáčaní Transformerov. Hoci to vtedy tajili, dnes priznáva, že spolu v tej dobe žili intímne.
Megan po natáčaní druhého dielu kritizovala režiséra Michaela Baya a z ďalších pokračovaní ju tak vyškrtli. Tým skončil aj jej tajný vzťah. "Myslím, že by som mohla potvrdiť, že ten vzťah bol romantický. Milujem ho. Nikdy som o tom úplne nemlčala, milujem ho," priznala teraz Fox. Megan tiež priznala, že s manželom Brianom zažívali po pôrode druhého syna ťažké chvíle a takmer sa rozišli. "Raz som sa na neho naozaj veľmi naštvala a napísala na jeho stenu pár veršov od Nietzscheho," prezradila Megan, ktorá má s Greenom päťročného Noaha, štvorročného Bodhiho a dvojročného Journeyho.
Foxová sa v roku 2006 zasnúbila s Greenom, ale vo februári 2009 sa rozišli. V júni 2010 sa vzali len pár mesiacov po tom, čo sa opäť dali dokopy. Na začiatku roka 2015 podala žiadosť o rozvod, ktorú neskôr stiahla, pretože bola tretíkrát tehotná.