Vladimír M. bol na základe obvinenia so zavraždeným v detstve dobrý kamarát a mohol od neho chcieť nielen prevzatie biznisu. Podľa polície žil Novotný najmä z výpalného, úžery a vymáhania. V pláne mal prevádzkovať aj budúcu diskotéku, ktorá by mu zarobila ďalšie peniaze. Jeho postavenie v podsvetí mu údajne závidel Vladimír M., ktorý mal mať záujem prebrať nielen jeho biznis, ale aj priateľku.
Jedinú cestu, ako to dosiahnuť, mohol vidieť v odstránení silného konkurenta. V noci 29. augusta 2001 mal podľa polície čakať na svoju obeť na Jilemnického ulici v Spišskej Novej Vsi spolu so Slavomírom S. Pár minút pred polnocou dorazil domov Novotný. Keď vystúpil zo svojho mercedesu, mali k nemu pristúpiť Vladimír M. a Slavomír S. Z dvoch zbraní zaznelo 5 výstrelov.
Na zemi zostalo rozstrieľané telo Emila Novotného. Keď doznela posledná rana, útočníci bežali k neďalekým garážam smerom do záhradkárskej oblasti, kde zmizli v tme. Vyšetrovateľ oboch obvinil z vraždy, za ktorú im v prípade dokázania viny hrozí trest na 12 až 15 rokov.
Emil Miťo Novotný bol známy aj tým, že vlastnil auto s poznávacou značkou MMMN 01, čo malo znamenať Mestský mafián Miťo Novotný. Ľudia na sídlisku Mier v Spišskej Novej Vsi si pamätajú na vraždu ešte aj dnes. „Mulik a Novotný boli od detstva dobrí kamaráti. Bývali vo vedľajších vchodoch, hrávali sa spolu,“ spomína Mária, ktorá priznala, že mala po vražde Novotného strach.
„Nebolo mi všetko jedno. Aj keď sa voči susedom správali veľmi slušne,“ podotkla dôchodkyňa. Výstrely počula aj Valéria z rovnakej bytovky. „Strieľalo sa tu. Potom Miťov otec zakričal: Zabil si mi syna! Bol to veľký šok,“ uzavrela.