Od tínedžerských rokov odborníci a tréneri považovali stredopoliara za veľký talent československého, respektíve českého futbalu. Svoje kvality predviedol už ako 17-ročný v drese Sigmy Olomouc, za ktorú nastupoval v rokoch 1986 až 1988. Roky 1988 až 1990 odohral v Dukle Praha, odkiaľ sa opäť na dva roky vrátil do Olomouca a so Sigmou v sezóne 1991/1992 postúpil do štvrťfinále Pohára UEFA.
Neobišli ho ani zahraničné ponuky. V rokoch 1992 až 1995 si obliekal dres Bayeru 04 Leverkusen v Nemecku, s ktorým v sezóne 1992/1993 získal Pohár DFB. Roky 1995 až 1999 absolvoval s prestávkou v materskom Olomouci v španielskom klube CD Tenerife. Český titul získal až vo farbách pražskej Sparty v sezóne 1999/2000. Nasledujúci ročník odohral opäť v Sigme, za ktorú počas svojich pôsobení absolvoval viac ako 140 zápasov a strelil 46 gólov.
Hapalovu hráčsku kariéru negatívne ovplyvnilo zranenie nohy. Ako hráč Tenerife si v roku 1996 zlomil nohu v zápase s Realom Sociedad San Sebastian. Pre zranenie si nezahral ani na európskom šampionáte v Anglicku. S českou reprezentáciou síce na EURO 1996 vycestoval, ale len v pozícii člena výpravy. Za bývalé Československo odohral v rokoch 1991 až 1993 21 zápasov a strelil jeden gól. Český reprezentačný dres si obliekol v desiatich dueloch. Koniec hráčskej kariéry oznámil v júni 2002, keď nastupoval najprv za České Budějovice a potom za Tatran Jakubčovice.
Trénerskú kariéru odštartoval v rokoch 2003 až 2004 na lavičke SFC Opava. V ročníku 2004/2005 pôsobil v FC Zlín. V sezóne 2005/2006 viedol Baník Ostrava. Ako hlavný kormidelník doviedol FC Nitra v ročníku 2007/2008 na tretiu priečku v najvyššej slovenskej súťaži. Po úspešnom pôsobení na Slovensku sa v sezóne 2008/2009 posadil na lavičku FK Mladá Boleslav. V roku 2009 Hapala angažoval MŠK Žilina, s ktorým vyhral v sezóne 2009/2010 ligový titul a doviedol ho aj do skupinovej fázy Ligy majstrov 2010/2011. V nej jeho zverenci v konkurencii londýnskej Chelsea, Olympique Marseille a CSKA Moskva nezískali ani bod. Žilinu vymenil za poľský klub Zaglebie Lubin, v ktorom pôsobil do roku 2013. Na Slovensko sa vrátil o rok neskôr, keď prebral FK Senica.
Slovenský futbalový zväz (SFZ) oslovil v roku 2015 Hapala s ponukou viesť národné mužstvo do 21 rokov. Mladíkov, medzi ktorými boli Milan Škriniar, Stanislav Lobotka či Albert Rusnák, koučoval do roku 2018. S tímom postúpil na majstrovstvá Európy 2017 tejto vekovej kategórie do Poľska, kde mladíci obsadili piate miesto. Iba tesne im ušla účasť v semifinále.
V marci 2018 začal Hapal trénovať Spartu Praha, ale jeho anabáza sa skončila už v júli. V októbri minulého roka ho SFZ angažoval na post hlavného trénera slovenskej reprezentácie. Na tejto pozícii vystriedal Jána Kozáka a stal sa prvým zahraničným koučom národného tímu, ktorému sa upísal na kvalifikačný cyklus EURO 2020: "Musím povedať, že tých momentov za roky na Slovensku sa nazbieralo mnoho. Či už to boli titul a postup do Ligy majstrov v Žiline, výborná partia hráčov v Senici, v Nitre prvé trénerské kroky a hneď úspešné. Samozrejme, postup s reprezentačnou dvadsaťjednotkou na majstrovstvá Európy. Opäť sa zišli kvalitní hráči a výborná partia a to teraz postupuje ďalej smerom k A-mužstvu. Všade, kde som pôsobil, mám dobré spomienky, ťažko sa niečo vyberá, bolo toho dosť."
SFZ má v prípade postupu na šampionát opciu na predĺženie kontraktu: "Samozrejme, každý človek chce byť v práci úspešný. Najväčším úspechom by bol postup na majstrovstvá Európy a urobíme preň maximum. Na to sa sústredím nielen ja, ale aj hráči."
