Reprezentáciu mal viesť v baráži o postup na majstrovstvá Európy proti Bosne a Hercegovine, ale po jej presunutí na jesenný termín sa rozhodol sústrediť už len na prácu v anglickom klube Stoke City.
"Nadobudol som presvedčenie, že teraz je ten pravý čas na to, aby som odstúpil," povedal 50-ročný O'Neill pre portál BBC. Reprezentáciu začal trénovať v decembri 2011 a zúčastnil sa s ňou na turnaji EURO 2016 vo Francúzsku, kde sa tím prebojoval do osemfinále. Pokiaľ Severné Írsko vyradí v semifinále odloženej baráže Bosnu a Hercegovinu, vo finále play off B-divízie sa stretne s víťazom duelu Slovensko - Írsko.